1.我国公立医院财务管理的现状。虽然经过了多年的改革和发展，我国的医疗体制尚不完善，公立医院补偿机制还不完善，与之相对应是，我国公立医院在财务管理方面也存在着许多薄弱之处。
（1）财务管理观念的落后和财务管理意识不强。过去，由于公立医院长期在计划经济的框架下运营，医院的财务管理活动受限于医药卫生体制、国家财政政策等客观因素的制约，公立医院的财务管理存在着一定的惰性，财务管理观念的更新存在着一定的滞后性。同时，公立医院是具有一定社会福利性的公益性医疗机构，享受政府财政的相关补助，加之公立医院在市场份额方面的天然的优势，所以，许多公立医院只等着适应政策环境的变化，加强财务管理创新的压力与动力不足，财务管理水平较为落后。
（2）财务管理人员的整体素质亟待提高。在公立医院中，由于整体人才的建设是以医疗、护理部门为主，财务部门一般被视为辅助科室的角色。医院对财务管理人员的来源要求不高，对其素质要求较低，因此公立医院的财务管理人员的素质相比其他行业来说较低。在医院内，财务管理人员不像医务人员那样，有较多外出学习、交流的机会，导致医院财会人员知识更新较慢、应用水平较低。以上因素导致医院的财会人员对财务管理的认识大多仅限于事后记账，而不是事前管理、事后分析，很难提取出有价值的医院财务活动信息并运用到医院的经营决策中。因此，面对新的财务管理环境，公立医院的财务管理部门必须下大功夫，提高财务管理人员整体素质。
（3）成本核算的目的不明确，方法不科学。近年来，由于医疗体制转型和其它社会因素的影响，许多公立医院之间互相攀比床位数、门诊量和年收入的增长，增加收入成了医院最重要的目标之一。但许多医院在迅速扩大规模的同时，却不能同时注重财务管理水平的提高，特别是不注重成本核算水平的提高。这将使医院的经营成本和经营风险大大增加，长此以往，医院将给自身留下沉重的负担。现行医院财务制度在核算原则和方法上与现代企业会计制度相差甚远，无法科学地开展有效的成本核算，导致医院的投资者、决策者和相关政府部门无法获得真实、有效的经营信息和数据，从而也将影响医院的可持续性发展。
（4）缺少具有前瞻性的综合性财务分析与评价。由于长期受计划经济的影响，目前，国内许多公立医院不重视财务管理数据的综合分析，财务管理人员观念落后，因循守旧，仍然是把大量的精力和时间用在标准化的记账、算账、报账等基本的传统技术层面，而缺少对医院经营活动的事前事后的分析和控制。财务报告只关注过去不注意未来，缺少对医院经营管理活动的整体的分析评价；偏重于货币性信息而对非货币性信息重视不够，只反映医院经营活动的结果而不能准确反映医院经营管理活动产生的社会效益等方面的好坏，医院财务管理分析报告缺乏相关性，只注重表面的浮华，而不关注管理质量的高低，容易引起医院经营管理决策的失误。
2.补偿机制改革对公立医院财务管理的要求。公立医院补偿机制的改革是整个医疗体制改革的重点和难点。由于其复杂性和深入性，补偿机制的改革必然会引起医院财务管理工作的变革。目前，对于公立医院补偿方式主要有财政补助、药品加成收入、医疗服务收费三个方面，实行医药分家或取消药品加成后，其补偿渠道将减少为财政补助、医疗服务收费两个方面。与之相对应，随着社会保险的扩面与各种医保系统的完善，过去的患者直接结算的医疗收费模式也将变为以总额预付制为代表的由医保机构统一审核后进行结算的新的结算模式，这种新的医疗服务消耗的补偿流程，要求医院在财务管理方面加大投入，如果管理不善，医院将会面临巨大的损失。因此，补偿机制的改革同时要求医院财务管理的创新。财务管理工作是医院整个管理工作的重心和关注点，是关系医院的生存与发展的关键因素。
3.充分利用国家医院体制改革的驱动因素，加强医院财务管理创新。随着现代医院理念的确立，医院财务管理战略也成了医院长期发展战略的一部分。以新的医疗体制的确立和医疗保险制度改革为标志的补偿机制的改革，要求医院进一步完善医院财务管理体系，创新财务管理模式，从而在激烈的医疗市场中立于不败之地。
（1）进一步明确公立医院财务管理目标，理清新形势下财务管理工作思路。医院财务管理水平的高低，直接影响到医院经营成果的好坏。随着医疗市场竞争的日趋激烈，创新性地做好医院财务管理工作，对于提高医院整体的经济效益和社会效益，显得尤为重要。片面地追求医院盈利最大化和片面地追求医院社会效益的最大化，是两种有失偏颇的观点，这是将医院的在经济层面上增强盈利水平与实现社会效益最大化错误地对立起来，都有悖于医院的发展规律，不利于医院财务管理目标的科学定位。随着医疗体制和医院补偿机制改革的深入，医院财务管理中存在的难点问题日渐显露，如在思想观念上、管理机制问题、人员素质等方面，医院财务管理方面的不足之处将不断暴露出来。
随着公立医院补偿机制改革的深入，公立医疗在财务管理方面将面临复杂的局面，新财务制度要求公立医院将遵循收入按来源、支出按用途划分的原则，科学调整医院的收支分类结构，同时随着医药分开改革进程的推进，药品加成对医院消耗的补偿作用将进一步弱化；另外，作为补偿机制重要组成部分的支付方式改革、医保及新农合的全面覆盖及其结算方式的改革等，都对医院的财务管理部门在更新理财观念、实施全过程财务管理、强化全成本核算、加强医院资金的管理以及提高财务人员的素质等方面提出了新的要求。
（2）加强财务管理人员队伍的建设，提高财务人员素质。近年来，各公立医院基础设施建设水平（包括财经部门的硬件设施）都有了长足的进展。但是，高水平的基础设施必须在高素质的人的操纵下才能发挥最大的作用。由于公立医院过去长期在旧的体制下运转，真正投入到市场经济环境中运营的时间并不长，因此，在部分公立医院中重技术、轻管理的倾向依然存在，从而造成医院的财务管理人员素质较低；同时，公立医院的主要领导的大多是医疗业务出身，财务管理意识不强，只重视医疗业务管理，忽视了以价值管理为中心的医院财务管理工作，这样容易引起医院的运行成本过高，造成医院资源的浪费。由于医院的财务管理工作专业性要求较高，需要面对的信息量越来越繁杂，与之相对应，财务管理工作对财务管理人员的素质的要求也越来越高。但长期以来，由于医院侧重于医务人员的培养，而对财务管理人员的整体要求与培养投入不够，这就使得一些医院缺乏较高素质的财务管理人员。
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