南京中医药大学治学严谨，学术氛围浓厚。半个世纪以来，名家云集、人才辈出，涌现了一批又一批蜚声海内外的专家、学者和教授，他们作为一代儒医大家和高等中医药教育专家，一代代名师薪火相传，名师云集蔚然成景。近年来，我校又有 7人先后荣获“国家级教学名师”、“全国模范教师”、“全国先进工作者”、“全国师德先进个人”、“国家级突出贡献中青年专家”等多项国家级荣誉称号，3人被列为国家人事部“‘百千万'人才工程”培养对象，45人先后享受政府特殊津贴，数十人被评为“江苏省名中医”、“江苏省中西医结合专家”、“江苏省有突出贡献中青年专家”等荣誉称号，近百人先后进入江苏省“333工程”和“青蓝工程”等人才培养梯队，为我校名师园地再添新锦。
学校学风浓郁，近三年毕业生大学英语四级考试通过率持续超过 80%，六级考试通过率达到30%左右，医学类毕业综合测定（含毕业论文）成绩优良率超过80%，非医类学生毕业设计（论文）成绩优良率超过75%.在“挑战杯”、“创业计划大赛”等各类竞赛中获得8项省级以上奖励。就业形势稳步发展，2004年，我校普通本专科毕业生年终就业率达97%，研究生就业率更是超过98%，大批毕业生已经成为国内外各级各类医疗机构、科研院所、医药院校、政府机构和著名企事业单位的中坚骨干。招生工作稳步推进，今年学校新招普通本专科生3346人、硕士生361人、博士生90人，各类境外长期生约120人。
学校科研实力雄厚，是江苏省海洋药物研究开发中心、江苏省植物药深加工工程研究中心、江苏省中药质量控制技术研究中心的挂靠单位。目前拥有 3个国家级重点学科、7个国家中医管理局重点学科建设点、3个江苏省重点学科、1个江苏省高校国家重点学科培育建设点，1个国家科技部规范化中药药理实验室、3个国家中医药管理局三级实验室、2个江苏省重点实验室和1个江苏省国家重点实验室培育建设点。科研成果硕果累累，近年来2项教学研究成果获得国家教学成果二等奖，81项科研成果获得厅局级以上各类科研成果奖，其中3项科研成果荣获国家科技进步三等奖、5项科研成果获国家中医药管理局级奖。仅今年半年间全校就入闱江苏省教育科学“十五”规划课题项目2项；通过省教育教学改革课题项目初审3项；申报国家级科技成果奖2项、中华中西医结合科技进步奖3项、中国中医药科技进步奖1项、省哲学社会科学论文论著奖6项；鉴定科技成果3项，申请发明专利4项。《南京中医药大学学报》是国际连续出版物、中国科技论文统计源刊、中国科技核心期刊、中国医学核心期刊、江苏省优秀期刊和江苏省一级期刊。学校图书馆是中国中医药文献检索中心分中心。由学校牵头编撰并担任总审定的《中华本草》，是对中医药几千年发展成就的系统总结，被李鹏同志誉为“当代《本草纲目》”。近年来，学校大批科技成果转化为现实生产力，为国家和地方经济发展做出了重要贡献，受到来校视察的李岚清等领导人的充分肯定。
