随着我国市场经济秩序的不断建立和完善，知识产权保护正在走上制度化、法制化的轨道。一些科研单位相继建立起知识产权管理制度和管理机构，不仅有力地促进了科学研究、技术开发和国际间的技术交流，而且也为科技档案管理提供了良好环境。但在具体实施中也存在着以下几个方面的问题：
1)将职务发明据为己有。
科研单位的技术成果主要是职务发明。然而受经济利益的驱使和小团体主义的局限，个别人将职务发明据为己有，去搞一些损公肥私的事情，影响了正常的科研秩序和经济利益。
2)专有技术的保密工作亟待加强。
在市场经济发展过程中，档案利用El益增多，但是也有个别人钻科技档案管理不严的空子，投机取巧，抄袭和剽窃他人成果，将人家辛辛苦苦从实践中得出的结果写进自己的论文。还有的人将与他人合作的产品配方归为己有，进而泄漏给他人或向一些地方小厂兜售，谋取私利。诸如这些现象都反映了新时期对科学技术成果的保密问题亟待加强，科技档案保密工作不容忽视。党和国家的利益需要保护，企事业单位的利益和公民个人的权益也需要保护。
3)技术档案中缺少核心内容。
档案是重要的信息资源，随着档案开放的扩大和社会利用的增多，档案信息的需求量也越来越大，特别是科技档案。一些科研院所的科技档案内容丰富，专业性强，是国家的宝贵财富。但近年来，由于种种原因，出现了只重视科技成果的推广实施，而忽视了科技文件材料的形成、积累和向档案部门移交归档；有的甚至肢解档案材料，只移交一般性材料而将关键性材料留下；还有的将科研报告中核心内容，用自己设定的代码代替，严重影响了科技档案的完整与质量，也丧失了档案的实际价值，不利于今后查考利用，不利于技术储备和成果的继承发展。
4)不注意科技文件的平时积累。
科技档案的完整准确是保证科技档案质量的关键，而科技档案的形成靠科技文件的平时积累。在日常科技活动中，会形成一定数量和种类繁多的科技文件，它不仅对当前工作有利，而且对今后的工作更具有指导和利用的价值。这些科技文件是非常宝贵的，它是科技档案的前身，我们应注意在各个重要阶段和环节进行科技文件的积累。有的科研单位，对科研计划的落实非常重视，而对科技文件的形成、积累和作为档案归档保存却重视不够，表现在科研实验原始记录不规范科研装置图纸不齐全，科研报告不完整，结果不仅对科研实验工作本身不利，同时也使科技档案工作受到影响。也给这部分档案造成不可弥补的损失，并给以后的后续工作留下了隐患。
5)执法监督中的不到位。
《档案法》已颁布实施多年，各级档案部门积极贯彻执行，在取得一定成绩的同时也还存在一些问题，比如《违反案法》的处罚问题还缺乏手段，象抄袭别人技术档案、丢失档案、损坏档案、档案泄密等问题，处理起来操作性不强，有的只是轻描淡写，或者以批评、检查代替处罚，而不是用法去制约，其结果必然会导致更多的人去违反《档案法》。几点建议：
1)树立一切为公的思想。
科研单位的技术成果大多是职务发明，顾名思义职务发明的成果属于公有财富，作为组织管理部门和领导者应对职工加强职业道德教育，使他们树立起一切为公的思想，把奉献精神作为一种道德追求，克服利己主义，正确处理国家、集体、个人三者之间的关系，正确处理人与人之间的合作关系，事事以国家利益为重。教育和要求每个人自觉承担对他人、对社会的职责和义务，对人类、对社会做到无私奉献。
2)加强科技保密，保护国家机密安全。
科技档案是科技活动的产物和真实记录，为了国家机密的安全和有利于科学技术与经济建设的发展以及科技成果发明人的权益，必须对科技档案的某些部分进行保密。就是在利用时限定使用范嗣，，严格遵守保密法规，该保密的不能内外不分，不该保密的不能借故保密影响利用，对于一些有产权的，更要保护其产权不受侵犯。
3)广泛收集，丰富馆藏。
日常科技活动产生大量的科技文件，我们在收集整理归档时，要按事物发展规律，抓住主要环节和重要阶段，按课题分类进行收集。科技活动到了成果鉴定阶段，就要将课题各个重要环节的原始记录、实验报告和相关的技术文件等收集齐全，因为鉴定阶段标志着课题研究工作的结束，材料已全部形成，需要认真地收集，及时整理归档。档案工作的主要任务是收集和保管好档案，供有关单位和个人使用，满足国民经济和社会发展的需要。要做到这一点就必须丰富馆藏，储备丰富的档案信息。
4)管好档案便于开发利用。
保管科技档案目的是将“死”的档案资料变成活的知识加以应用，指导科研实践活动，发挥更大的价值。所以，对于科技档案工作者来说，应该积极主动地采取各种方式、方法，开展和推进科技档案的利用工作，使科技档案在社会主义现代化建设中产生应有的经济效益和社会效益，这是科技档案工作的基本任务。当然，利用档案要在不泄密的前提下进行，否则将会给国家机密安全带来损失。科技档案不仅对本单位、本部门具有利用价值，对其它单位、部门同样具有利用价值。我们是社会主义国家，要在保护知识产权前提下，做好为社会利用提供服务工作，造福人类，发展社会。我们要最大限度地开发利用档案，要根据本单位的具体情况，了解服务对象的要求，改善各种可能的服务手段和形式，开展好档案利用工作。
5)健全并严格执行科研管理制度，加强科研管理力度。
科技档案管理，离不开科研管理制度的支持。各级科研管理部门应坚持用法律手段履行各自的职能，建立健全适应新形势下的各种规章制度，把必要的行政手段和经济手段纳入制度进入法制的轨道，以加强市场经济条件的科研工作的宏观管理。不断总结和推广宏观和微观管理科技档案的经验，帮助各专业主管与单位建立和完善科研工作、档案工作的约材料管理论文束、激励、监督机制，使全社会的档案工作逐步走出一条自我约束、自我完善、自我发展的新路子，这是科研宏观管理，加强科研管理力度的最终目的和要求，也是我们为之努力的方向。
