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【北京蛋白质组研究中心】蛋白质网络的特征研究

本文作者:林锦贤;胡尊胜;吕暾;成功正常投稿发表论文到《福州大学学报(自然科学版)》2014年03期,引用请注明来源400期刊网!



【摘要】:基于复杂网络理论研究蛋白质网络的特征.构建了蛋白质网络,当截断距离R为0.7nm时,单体蛋白网络表现出明显的小世界性质.分析了蛋白质网络的分层结构,当截断距离增大时,分层指数b值减小,截断距离R为2.4nm时,分层指数b与网络规模正相关.研究结果表明,单体蛋白质网络及其对应复合物中肽链网络中接近中心度和介数中心度较高的残基均是非极性、疏水性氨基酸.
【论文正文预览】:0引言近年来,复杂网络研究发展迅速,人们开始考虑节点数量多,结构复杂的实际网络的整体特性,称之为“网络的新科学”[1].在信息技术领域,如Internet网络、电力网有广泛研究[2-3],Vendruscolo等[4]构建了蛋白质氨基酸网络,并用小世界的视角研究在蛋白质折叠过程中的关键残基;Am
【文章分类号】:Q51
【稿件关键词】:复杂网络蛋白质网络截断距离拓扑特征
【参考文献】:
  • 李海彦;;复杂网络在蛋白质折叠中的应用[J];德州学院学报;2008年02期
  • 郭本华;;复杂网络统计参量对病毒传播速率的影响[J];安顺学院学报;2010年06期
  • 张律文;谢江;陈建娇;张武;;基于复杂网络模型的基因调控网络的计算模拟[J];计算机科学;2010年01期
  • 靳静;董峰;唐一源;冯洪波;张晔;赵庆柏;闫芬;李姗姗;冯士刚;;探测静息状态大脑活动的关键区域[J];自然科学进展;2007年05期
  • 周塔;邹盛荣;顾爱华;卫丽;徐莹莹;;因子-蛋白网络的实证统计研究[J];科技信息;2009年35期
  • 常珊;焦雄;王美华;田绪红;;蛋白质氨基酸网络研究进展[J];现代生物医学进展;2011年01期
  • 丁德武;黄海生;陆克中;何小青;计博婧;;代谢网络结构与功能的复杂网络分析[J];计算机与应用化学;2011年03期
  • 高蕾;郭进利;;生物网络研究进展述评(英文)[J];生物信息学;2011年02期
  • 谢雪英;李鑫;曹晨;;基于复杂网络的蛋白质结构域组进化分析[J];生物物理学报;2010年12期
  • 曹俊杰;郑利斌;陈铭;;蛋白质互作网络的分形分析[J];浙江大学学报(理学版);2011年04期
  • 冯子男;潘义;;细胞信号转导的复杂网络分析[A];第九届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2007年
  • 方亚平;郭延芝;文志宁;李梦龙;;基于氨基酸残基网络的蛋白质折叠速率预测[A];第十届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2009年
  • 焦雄;苏计国;陈慰祖;王存新;;氨基酸网络特征量在去折叠路径上的变化[A];第十次中国生物物理学术大会论文摘要集[C];2006年
  • 赵庆柏;薛绍伟;曹宸;唐一源;;整体身心调节对脑内信息加工效率的影响[A];第十一次中国生物物理学术大会暨第九届全国会员代表大会摘要集[C];2009年
  • 王存新;焦雄;陈慰祖;李春华;;基于能量的氨基酸加权网络的构建及其应用[A];中国生物医学工程进展——2007中国生物医学工程联合学术年会论文集(下册)[C];2007年
  • 吴俊;邓宏钟;朱大智;谭跃进;;蛋白质相互作用网络的度秩函数与度分布[A];2006全国复杂网络学术会议论文集[C];2006年
  • 许醇穗;刘曾荣;;生物网络抑制度负关联性的一种机制[A];第十二届全国非线性振动暨第九届全国非线性动力学和运动稳定性学术会议论文集[C];2009年
  • 常珊;李春华;龚新奇;陈慰祖;王存新;;蛋白质不同区域的氨基酸保守性网络分析[A];第十次中国生物物理学术大会论文摘要集[C];2006年
  • 本报记者 李学华;新发现挑战旧观点[N];科技日报;2007年
  • 姜亦君 本报记者 江世亮;畅谈未来生命科学路线图[N];文汇报;2005年
  • 李天舒;大脑运动控制研究有新进展[N];健康报;2007年
  • 李莹;SCN中节律行为与生物网络中Motif行为的研究[D];上海大学;2008年
  • 张建宝;振子网络上的同步及其在生物学中的应用[D];上海大学;2008年
  • 刁元波;复杂网络理论和细胞自动机在生物信息学中的应用研究[D];四川大学;2007年
  • 陆晨琪;酵母生物网络结构与功能进化的研究[D];复旦大学;2008年
  • 齐立省;基于相对熵和复杂网络方法的蛋白质折叠与设计理论研究[D];北京工业大学;2009年
  • 顾全;基于集成智能的膜蛋白受体结构与功能研究[D];东华大学;2010年
  • 贺勤斌;两个复杂系统中的相关问题研究[D];上海大学;2012年
  • 尤著宏;基于图和复杂网络理论的蛋白质相互作用数据分析与应用研究[D];中国科学技术大学;2010年
  • 毛黎明;分布式并行处理与复杂网络在蛋白质折叠中的应用[D];武汉理工大学;2005年
  • 陈桂华;基于GEP多基因族编码的复杂网络社团划分研究[D];江西理工大学;2013年
  • 董峰;大脑中负激活与默认活动网络的探索[D];大连理工大学;2007年
  • 冯洪波;功能成像中的负激活及其网络探索[D];大连理工大学;2008年
  • 于连江;易物模型研究及其在生物调控网络中的应用[D];吉林大学;2010年
  • 曹鹏飞;可实现振荡功能的生物模体的设计性研究[D];南京航空航天大学;2011年
  • 李海彦;用复杂网络研究蛋白质折叠[D];山东师范大学;2009年
  • 石建军;复杂网络的点强度相关研究及其复杂网络在生物领域的应用研究[D];扬州大学;2009年
  • 张立婷;生物序列的内在性质[D];江南大学;2008年
  • 周洪伟;复杂网络理论及其在生物网中的应用[D];南京航空航天大学;2007年

【稿件标题】:【北京蛋白质组研究中心】蛋白质网络的特征研究
【作者单位】:福州大学数学与计算机科学学院;福州大学生物科学与工程学院;
【发表期刊期数】:《福州大学学报(自然科学版)》2014年03期
【期刊简介】:0......更多福州大学学报(自然科学版)杂志社(http://www.400qikan.com/qk/5295/)投稿信息
【版权所有人】:林锦贤;胡尊胜;吕暾;


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