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【寡核苷酸】寡核苷酸基因芯片检测HBV基因型方法的建立与临床研

本文作者:唐向荣;张冀申;赵辉;赵建龙;成功正常投稿发表论文到《中华检验医学杂志》2007年10期,引用请注明来源400期刊网!



【摘要】:目的建立寡核苷酸基因芯片检测HBV基因分型的方法并对HBV携带者基因型进行临床分析。方法根据Genbank中已发表的128株HBV全基因组序列系统进化分析结果设计了A~H不同HBV基因型的特异探针及巢式PCR引物。利用反向杂交原理,先将不同HBV基因型特异的寡核苷酸探针固定在芯片上,再与地高辛(Dig)标记的扩增产物杂交从而检测HBV基因型。本研究检测了200例HBVDNA阳性患者,为了验证基因芯片检测的结果,随机选取其中40份样本进行直接测序。结果在200份血清样本中检测到B、C基因型以及BC混合型,依次占11.5%(23/200),80.5%(161/200),8%(16/200)。在与测序方法进行对比的40份样本中,除3份例混合型用测序方法不能检出混合感染外,利用测序结果进行系统发育分析得到的结果与基因芯片检测结果一致。进一步的克隆分析发现这3份样本均为混合感染。结论基因芯片是进行HBV基因分型的方便可靠的工具,并能更好地检测不同基因型混合感染的情况。本研究中,HBV基因型以C型为主,与B型相比,C型HBV感染者病情较为严重。
【论文正文预览】:据统计全球超过40亿人感果胜n”,。1习‘、染患者超过3亿5千万,这部分患者死于与HBV利关的肝功能丧失或肝硬化的风险高出常人20%,30%。基于全基因组序列不低于8%的差异,HB、病毒被分为A一HS个基因型川。研究显示,亚洲HBVC基因型比B基因型更易导致包括肝硬化、肝细胞癌(Hcc)在
【文章分类号】:R450
【稿件关键词】:肝炎病毒乙型基因型芯片分析技术
【参考文献】:
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【稿件标题】:【寡核苷酸】寡核苷酸基因芯片检测HBV基因型方法的建立与临床研究
【作者单位】:中国科学院上海微系统与信息技术研究所;
【发表期刊期数】:《中华检验医学杂志》2007年10期
【期刊简介】:《中华检验医学杂志》杂志是由中华人民共和国新闻出版总署、正式批准公开发行的优秀期刊,中华检验医学杂志杂志具有正规的双刊号,其中国内统一刊号:CN11-4452/R,国际刊号:ISSN1009-9158。中华检验医学杂志杂志社由中国科学技术协会主管、中华医学会主办,......更多中华检验医学杂志杂志社(http://www.400qikan.com/qk/6448/)投稿信息
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