学校坚持特色制胜、争创一流，形成一批优势和特色学科专业。现有中医基础理论、中医医史文献2个国家重点学科和中医内科学1个国家级重点（培育）学科；有中医学、中药学、针灸推拿学和制药工程4个国家级特色专业，1个教育部综合改革试点专业，11个省级特色专业；建设3门国家级精品开放课程，33门省级精品课程。有1个国家卫生部技术准入专科，国家中医药管理局重点学科29个。
学校注重科技创新驱动，打造一流科研平台，取得丰硕成果。现有中医学、中药学、中西医结合3个博士后科研流动站，设有1个国家教育部重点实验室、6个国家中医药管理局三级重点实验室，2个国家中医药管理局重点研究室、2个山东省重点实验室、3个山东省工程技术研究中心、1个山东省工程实验室和6个山东省高校重点实验室，立项牵头1个山东省高等学校协同创新中心。“十一五”以来，共承担厅局级以上科研课题1028项，其中国家级项目223项。获首届国家科技大会奖2项、国家科技进步二等奖3项、国家技术发明奖1项、省部级科技进步一等奖6项、省部级科学技术一等奖10项。学校是科技部认定的“国家科技成果重点推广项目技术依托单位”、“国家中药现代化、产业化规范种植项目承担单位”，拥有国家临床研究基地、国家重大新药创制平台（山东）中药单元平台，有山东省人文社科研究基地1个，省级重点学科14个、重点专科10个、重点实验室24个。
在建设高水平特色名校的征程上，学校始终坚持社会主义办学方向，紧紧围绕立德树人根本任务，坚持人才培养的中心地位与中医药学科的核心地位，坚定不移实施富民强校基本方略，充分发挥中医药优势，强内涵、立特色、树品牌、促发展，全面提升学校的综合实力和办学水平，努力培养德智体美全面发展的社会主义合格建设者和可靠接班人。
