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青海大学藏医学院始建于1987年,学院前身是青海藏医学院。1995年青海藏医学院与青海医学院整合。2004年,青海医学院与原青海大学整合,组建新的青海大学,青海藏医学院更名为青海大学藏医学院。医学|教育网搜集整理经过整合和省部共建的青海大学于2008年获准进入“211工程”全国重点建设大学行列。学院在2000年获得藏医药学硕士学位授予权,2006年获得藏医药学博士学位授予权。
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