中药房面积达290平方米，设有中药饮片调剂室、中成药调剂室、中药饮片库房、中成药库房、周转库及中药煎药室等。门诊设立有1200平方米的中医综合治疗区，建立有北京市第四批名老中医王国华老中医工作室。海淀区名中医药专家师承工作由我院承担组织管理，其中郭志强老中医药专家学术基层工作站、郭维琴老中医药专家学术基层工作站、周德安老中医药专家学术基层工作站、聂莉芳老中医基层学术传承示范点、王国华海淀区名老中医工作室和冯学功海淀区名老中医工作室落户我院。我院还是海淀区经方培训基地，并于2013年在全院开展中医护理示范岗建设活动，将中医药护理特色技术广泛应用到临床护理工作中。
医院现有中医诊疗设备达8类，45种。鼓励开展中医诊疗项目，现全院开展中医诊疗技术项目52种。门诊使用中医药方法治疗人次占总人次的77.99%，运用非药物中医技术治疗人次占总人次的25.49%.门诊处方中，中药（饮片、成药、医院制剂）处方比例占51.30%，中药饮片处方占门诊处方总数的比例逐年增加。病房主病主证采用中医、中西医结合治疗率达55%以上。肾病科、脑病科、针灸科和妇科杂病等专科专病中医药特色优势显著。
为了贯彻北京市人民政府促进首都中医药事业发展的精神，改善就医条件，提升医疗服务能力，在市区两级政府的大力支持下，我院病房楼改扩建工程于2014年6月开工建设，施工工期约3年，竣工后医院规模达到三级甲等医院水平。
为了保证医院在改扩建期间正常运转及周边百姓的就医需求，我院在北京市海淀区杏石口路6号（四季青桥西200米路北）开设了北京市中西医结合医院北院区，医院全部内科住院病区（包括呼吸消化内科、心血管内科、脑病科、肾内科、针灸科、肿瘤科、血液透析室）已迁至北院区，北院区同时设有内科门诊、口腔科和中药房、西药房、检验科、放射科、B超室等辅助科室。原妇产科、外科、骨科病区、麻醉手术科和皮肤美容整形科仍保留在老院区提供医疗服务，改扩建期间老院区原门急诊诊疗服务照常，同时，老院区对需要住院的患者提供专车服务。
