海南医学院的前身是海南医学专科学校，由创办于1947年的私立海强医事技术学校和创办于1948年的私立海南大学医学院合并而成。1973年设立直属附属医院。1977年起开办临床医疗专业本科。1983年并入海南大学，改称海南大学医学部。1993年经国家教委批准成立海南医学院，隶属海南省人民政府主管。1994年获准授予学士学位。1996年被国家教委确定为本科教学工作合格学校。2000年校本部从海口市龙华路旧校区迁至学院路新校区。2003年被国家教育部确定为联合培养硕士学位研究生单位。2004年起与北京大学联合招收硕士研究生。现为海南省唯一的高等医学院校。
学院占地面积557060.99M2，分城西、龙华两个校区。现有教职工（含附院）1300多人，专任教师320人，其中研究生学位占46.3%.分别聘请了近50名国内外著名的专家学者为学院名誉教授、客座教授、特别顾问。下设高等职业教育学院、临床学院、预防医学系、护理学系、药学系、检验医学系、中医学系、口腔医学系、基础医学部、人文社会科学部、外语部、信息技术部、体育部等院系部；有6个基础实验室、5个专业实验室。设立附属医院3家（直属1家、非直属2家），病床总数2320张；临床教学（实习）医院20家，开放病床数6433张。另有教学基地9个。
学院坚持“立足本科教育，积极发展研究生和留学生教育，普通教育与继续教育并重”的办学方针，以多种模式拓展办学规模。目前开设临床医学、医学检验、预防医学、药学、护理学、中医学、口腔医学、医学影像学、中西医临床医学、康复治疗学等10个本科专业，课程总门数达207门。
校园已构成了主干千兆带宽、百兆到终端的校园网络架构体系，并以100Mbase的带宽连接中国教育与科研计算机网海南省节点，实现了Internet的高速连接。建有学院门户网站、电子邮件服务系统、文件传输服务系统、电子社区，实现了校园Intranet功能。新校区已具备无线上网功能。医'学教育网|整理图书馆是海南省唯一的部、省两级医药卫生科技项目查新咨询单位，有馆藏文献511584册，与CADLIS等国内数字图书馆等建立了广泛的文献传递服务关系。主编出版《海南医学院学报》、《海南医学院院报》等刊物。
学院基本上面向全国招生。现有在校生7200余人，“十一五”末将达到12000人。建校以来，为国家和社会培养了近20000名合格的医学人才。在造就海南基层卫生骨干队伍、利用现代技术促进医学教学改革等方面有特色。
学院坚持“改重基础研究为主为重应用研究为主，改抓小课题为主为抓大课题为主，改分散单一研究为主为集体攻关为主”的科研工作方针，充分发挥自身的人才优势和海南省的资源优势，将分子生物学、转基因研究、植物化学、干细胞研究、南药与海洋药物开发作为科研的主攻方向。近几年，科研工作发展迅速，先后成功申报了国家863课题2项实现海南省“零”的突破：“精子载体法转基因杂交水牛的研究”成果部分达到国际先进水平，先后发现并成功克隆出2个人类新基因，经审核已获准加入国际基因库（编号分别为GenbankAF157027和GenbankAF160979）；获省级科技奖14项，在研国务院各部委课题20项、国家自然科学基金课题14项。现有省级重点学科2个（妇产科学、天然药物化学）；省级重点实验室2个（海南省热带药用植物研究开发重点实验室、海南省热带病原学研究重点实验室）；省级精品课程4门；省级重点课程3门。已形成和正在培育分子生物学、生殖医学、热带医学等一批特色学科。
