学校重视临床和实践教学。有2所直属附属医院（省中医院、原济南铁路中心医院）。有7所非隶属附属医院，66处实习教学基地。目前，全日制在校生8049人，其中普通本专科生7052人，研究生743人'外国留学生和港澳台学生186人，成人脱产专科班学生68人，另有函、业大学生5145人。同等学历在职申请硕士学位学生650人。各类在校生近14000人。
学校具有较强的科技创新能力。有4个研究所（文献、天然药物、针灸、中西医结合）、6个独立设置的研究室，有2项成果荣获首届全国科技大会奖，有1项成果获第十四届日内瓦国际发明展览会金奖。1991年以来荣获国家科技进步奖、国家发明奖等国家级科技奖励6项，获部、省、厅级科技奖励237项，有60余项科研成果得到转化。现承担国家级重大科研项目2项、国家级课题14项、省部级课题44项。主办的《山东中医药大学学报》为中国科技核心期刊，在全国同类期刊中享有盛誉。与山东省中医药学会共同主办的《山东中医杂志》2001年入选中国期刊方阵。还承担《中国肛肠杂志》、《中国中西医结合影像杂志》编辑出版任务。1990年以来，编著出版医药、社科等各类教材和专著1200余部，在国家中医管理局组织的“新世纪高等中医药教材”编写工作中，担任了32部教材的主编和副主编任务。据中国科学技术信息研究所《中国科技论文统计与分析》公布的结果，学校2000年和2001年连续两年发表的科技论文居全国医学高校前30位。是科技部认定的“国家科技成果重点推广项目技术依托单位”、“国家中药现代化、产业化规范种植项目承担单位”。
学校拥有实力雄厚的师资队伍。现有教职医护员工3340人，其中校本部904人。有专任教师467人，终身教授2人，博士生导师38人、硕士生导师204人，教授和主任医师等159名、副教授和副主任医师等440名。有36位专家享受国务院政府特殊津贴，14位省部级专业技术拔尖人才、7位省部级有突出贡献的中青年专家、5位中国百名杰出青年中医、22名省级中青年学术骨干和学科带头人培养对象，5位“山东省有突出贡献的名老中医药专家”、31位“山东省名中医药专家”。37名教师获“山东省千名知名技术专家”称号。特聘4位院士为学校名誉教授。
学校十分注重对外交流与合作，先后与日本、韩国、德国、英国、澳大利亚及东南亚等国家和地区的十余所大学建立并保持长期友好合作关系。与德国、英国的有关医疗机构联合在国外办医，经教育部批准与马来西亚中医学院联办7年制本硕连读班。留学生规模位居省内院校前列。
目前，学校正在以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，牢固树立和认真贯彻落实科学发展观，同心同德，干事创业，开拓进取，全面实施学校第三次党代会确立的“教学立校、科研兴校、人才强校”基本办学方略和“两步走”发展战略，积极推进“创优迎评”和新校区建设两项伟大的再创业工程，为实现建设位居全国中医药院校前列强校的宏伟目标而努力奋斗。
