南通市中医院是“三级甲等中医院”和“全国示范中医院”、南京中医药大学和南通医学院教学医院。先后获得“全国红旗单位”、“全国医药卫生先进集体”、“省文明医院”、“省、市文明单位”、“省抗非先进集体”、“南通市服务经济建设最佳单位”、“市十佳医院”等称号。
医院科室设置齐全，人才济济，设备先进，专科特色显著。医'学教育网|整理共有一级临床和医技科室18个，二级临床科室14个，核定床位300张。医院现有职工460人，其中高级职称93人，中级职称129人。有全国名中医4人，省名中医3人，市名中医5人，享受国务院专家特贴7人。消化专科为我市唯一的省级重点中医专科，风湿病专科、蛇伤专科、中医妇科为市级重点中医专科，在省内外有较大影响。骨伤科、肾病专科为重点建设专科，骨伤科的颈椎手术、关节置换手术达国内先进水平，肾病专科开展的亲体肾移植为省内首例，所开展的钬激光碎石、钬激光治疗静脉曲张在省内处于先进水平。
医院拥有核磁共振、螺旋CT、DSA、数字X光机、C臂X光机、数字X线成像系统、全自动生化仪、彩超、电子胃镜、钬激光、准分子激光等大型仪器设备。
建院以来，获科研成果奖40多项，其中“季德胜蛇药片”、“拔核疗法治疗瘰疠”、“新药金荞麦”为国家级成果。
近几年，医院紧紧围绕“中医很优秀，西医也一流”的奋斗目标，深化改革，强化管理，引进人才，改善服务，业务量快速增长，2004年，门急诊量26.15万人次，出院人数6420人次，总收入1.02亿元，四年中，医院的业务量和收入实现了翻两番。
南通市中医院人正以“继承、创新、求实、奋进”的精神风貌，向着基本现代化医院的目标迈进！
