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新疆农业大学学报杂志是由中华人民共和国新闻出版总署、正式批准公开发行的优秀期刊。自创刊以来，以新观点、新方法、新材料为主题，坚持"期期精彩、篇篇可读"的理念。新疆农业大学学报内容详实、观点新颖、文章可读性强、信息量大，众多的栏目设置，新疆农业大学学报公认誉为具有业内影响力的杂志之一。新疆农业大学学报并获中国优秀期刊奖，现中国期刊网数据库全文收录期刊。
国家新闻出版总署收录、中国知网收录期刊、维普中文期刊全文收录、万方数据库全文收录期刊、CA 化学文摘(美)(2011)、Pж(AJ) 文摘杂志(俄)(2011)。
核心期刊：
中文核心期刊(2008)
期刊荣誉：
Caj-cd规范获奖期刊；1996年在第二届全国农业期刊评比中荣获“优秀农业期刊奖”；1997年荣获第二届全国优秀科技期刊评比“三等奖”；1999年在全国高等学校自然科学学报及教育部优秀科技期刊评比中荣获“三等奖”；2005年获新疆期刊奖；2004年获全国高校科技期刊评比二等奖。
新疆农业大学学报杂志主要栏目：
主要栏目：本刊专稿、经济学研究、哲学研究、文艺学研究、历史学研究、东北历史与文化、政治学研究。
2016年 第3期目录
(173)库尔勒香梨采后果实不同部位的呼吸多途径差异研究潘俨[1,2];孟新涛[2];郭铁群[3];薛素琳[2];赵多勇[4];廖康[1]
(179)50份新疆狗牙根种质种子繁殖表型特征的研究柴艳[1];孙宗玖[1,2];李培英[1,2]
(186)不同天然居群新疆野苹果休眠枝条可溶性蛋白和保护酶活性对低温的响应王泽华;秦伟;马依努尔姑·吐地
(191)狗牙根抗寒相关性状与分子标记的关联分析张延辉;于辉;马亮;李培英;阿不来提
(198)棉花黄萎病抗性鉴定及抗病相关的分子标记检测马前程[1];王丽丽[1];张海萍[1];郭文超[2];曲延英[1];顾爱星[1]
(206)新疆野扁桃群落物种多样性及区系特征分析吾买尔夏提·塔汉[1];邱娟[2];黄俊华[3]
(211)整联蛋白beta2亚基在兔动脉粥样硬化进展模型中表达量变化研究刘昌华[1];王乐[2];迟彦[1];高泽红[1]
(218)牛源金黄色葡萄球菌和牛源停乳链球菌灭活菌苗对小鼠免疫效果的比较与评估李善春;周婷婷;冯凯;江航;苏艳
(222)马铃薯干腐病病菌生物学特性及室内药剂筛选王丽丽;徐韬;李琳;相阳;魏涛;李克梅
