该刊被以下数据库收录：
《疑难病杂志》不断发展壮大，现已成为国内外有一定地位的学术性刊物：
1、收录情况：
国家新闻出版总署收录、中国知网收录、维普期刊网收录、万方数据库收录、哥白尼索引收录
CA化学文摘(美)、AJ文摘杂志、中国生物医学文献数据库、中文生物医学期刊文献数据库收录
2、统计源期刊：
中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊)
中国学术期刊综合评价数据库(CAJCED)统计源期刊
3、数据：
DC数据、MARC数据
4、馆藏：
国家图书馆馆藏、上海图书馆馆藏
5、影响因子：
截止2014年万方：影响因子：0.61；总被引频次：1729
截止2014年知网：复合影响因子：0.413；综合影响因子：0.365
6、期刊荣誉：
中国生物医学核心期刊
疑难病杂志杂志主要栏目：
专家笔谈、论著、临床研究、络病论坛、罕少见病例、误诊误治分析、疑难病例（理）讨论、名医精粹、释疑解难、继续教育
疑难病杂志杂志社已发表论文目录：
1、胰腺实性假乳头状瘤1例韩明军
2、老年人肺炎临床特点分析董贤明
3、以幻觉为首发症状的癫痫1例严钢莉
4、加替沙星致血糖急骤升高1例郑红宇
5、系统性红斑狼疮误诊为药疹1例严立平
6、幼儿皮氏罗尔斯顿菌败血症1例何志慧
7、左氧氟沙星致血小板减少性紫癜1例胡凯
8、环状软骨瘤误诊误治1例李旭征，张淑香
9、应激性心肌病10例临床分析甘舜进，张海滨
10、高龄男性巨大乳腺癌1例孟婷，高飞，杨义
11、醉酒后自发性膀胱破裂1例王保信，王振生
12、腹型过敏性紫癜误诊为消化道出血1例周艳萍
13、氟伐他汀对老年人颈动脉粥样斑块的影响李芳，王春梅
14、参麦注射液治疗原发性低血压临床观察贾连旺，范寿坤
15、从络病理论解读"六经辨证"本质翁超明，WONGChao-ming
16、假性下腔静脉瘤误诊为腰大肌脓肿1例戴哲浩，陈飞，陈维华，康意军
17、右室新起搏方法的实践与探讨邹宝明，王景武，徐敏，孙克禄，鲍正毅
18、小儿偏头痛的临床分型研究黄瑞凝，伍志勇，黄小星，商建青，陈宝田
19、自拟益元活血汤对恶性肿瘤患者血瘀状态影响的观察呼健，冯宇，曹科，HU
